几种方案

1 脚本化：采用 Iron 或 集成其它脚本引擎。
2 AppDomain：微软的 Add In 框架就是为这个目的设计的。
3 分布式 + 负载平衡 ：轮流更新集群中的服务器。
4 Assembly.LoadFrom + 强签名程序集：因为相同标识的程序集在内存中只会加载一次，所以每次功能发生变化，都要增加程序集的版本号。
5 Assembly.Load +  + 强签名程序集 + GAC：因为相同标识的程序集在内存中只会加载一次，所以每次功能发生变化，都要增加程序集的版本号。
6 Assembly.LoadFile：Assembly.LoadFile 可以多次加载相同标识的程序集，只要程序集所在的目录位置不同。

重点说一下 Assembly.LoadFile

测试代码

复制代码 代码如下:
using System;
using System.Collections.Generic;
using System.Linq;
using System.Text;
using System.Threading.Tasks;
using System.Reflection;
using System.IO;
using Contracts;

namespace Test
{
    class Program
    {
        static void Main(string[] args)
        {
            SetupPlugEnvironment();

            ExecuteOperator("1.0.0.0");
            ExecuteOperator("2.0.0.0");
        }

        private static void ExecuteOperator(string version)
        {
            var operatorType = Type.GetType("Implements.Operator, Implements, version = " + version + "");
            var operatorInstance = Activator.CreateInstance(operatorType) as IOperator;
            operatorInstance.Operate();
        }

        private static void SetupPlugEnvironment()
        {
            AppDomain.CurrentDomain.AssemblyResolve += CurrentDomain_AssemblyResolve;
        }

        static Assembly CurrentDomain_AssemblyResolve(object sender, ResolveEventArgs args)
        {
            AssemblyName name = new AssemblyName(args.Name);

            var file = Path.Combine(
                @"E:\Coding\HappyStudy\LoadContextStudy\Test\bin\Debug\Plugs",
                name.Name,
                name.Version.ToString(),
                name.Name + ".dll");

            Console.WriteLine("加载插件：" + name.Version);

            return Assembly.LoadFile(file);
        }
    }
}

说明
调用 Type.GetType 会导致 CLR 执行程序集探测过程，在正常的探测路径下没有找到程序集就会触发 AssemblyResolve 事件，为啥会触发两次呢？我还不知道。

微软不推荐使用 LoadFile（会加载相同标识的程序集多次），Add In 采用的是 AppDomain，MEF 采用的是 LoadFrom。